BIOKIMIA TUMBUHAN

 Tugas Kelompok: Klik disini

Pertemuan ke-1: Klik disini

Pertemuan ke-2: Klik disini

 

 

 

RENCANA KEGIATAN PROGRAM PEMBELAJARAN (RKPP)

PRODI MAGISTER ILMU PERTANIAN

FAKULTAS PERTANIAN

UNIVERSITAS RIAU

 

 

 

  1. Jurusan/Program Studi                  :  Agroteknologi/ Magister Ilmu Pertanian
  2. Mata Kuliah                                    :  Biokimia Tumbuhan
  3. Kode Mata Kuliah                          :  AGR (513)
  4. Jumlah Satuan Kredit Semester    :  3 (2-1) SKS
  5. Jumlah Temu Muka                       :  16 kali

 

  1. DESKRIPSI MATA KULIAH :

Membahas tentang sel dan organel tumbuhan, fotosintesis, respirasi, metabolism biomolekul, penekanan dilakukan pada protein, enzim dan DNA. Selain itu dipelajari juga senyawa metabolik sekunder serta genome sel dan rekayasa genetik tumbuhan.

  1. 7.      STANDAR KOMPETENSI :

Setelah mempelajari mata kuliah Biokimia Tumbuhan diharapkan mahasiswa mampu memahami metabolisme yang terjadi dalam sel tumbuhan dan proses biokimia yang terkait dengan rekayasa genetika tumbuhan serta mampu mengaplikasikan dalam bidang pertanian.

  1. Sistem Penilaian:
  • Praktikum                                                                              :     25 %
  • Quiz                                                                                      :       5 %
  • Tugas                                                                                    :     10 %
  • Ujian Tengah Semester  (1 kali)                                              :      30 %
  • Ujian Akhir Semester (1 kali)                                                  :     30 %

 

 

  1. Sumber Belajar:
  • Heldt, H-W.  (2005).  Plant Biochemistry. Elsevier, Inc. California.
  • Salisbury, F. B., Ross, C. W. (1992).  Plant Physiology. 4th edition.  Wadsworth Publ. Co., California
  • Nelson, D. L. , Cox, M. M.  (2008).  Lehninger Principles of Biochemisstry. 5th edition.  W.H. Freeman, New York.
  • Tymoczko,J. L., Berg, J. M., Stryer, L. (2010). Biochemistry: A short course. W. H. Freeman and Company, New York.
  • Catatan: Selain handout akan diberikan oleh masing-masing dosen, mahasiswa dapat menggunakan buku versi terjemahan dari no.2, 3 (Dasar-dasar Biokimia Lehninger jilid 1,2 dan 3), dan 4 (Biokimia Stryer) yang dapat diperoleh di toko buku buku.

 

RENCANA KEGIATAN PROGRAM PEMBELAJARAN (RKPP)

 

KOMPETENSI DASAR

MATERI PEMBELAJARAN

KRITERIA PENILAIAN (INDIKATOR)

ALOKASI WAKTU

 

Mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi protein

 

 

Protein & Enzimologi: Struktur protein, fungsi protein, hubungan struktur protein dengan fungsinya

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami fungsi dan kinetika enzim

 

Enzim dan kinetika enzim

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami senyawa penghambat enzim, tipe-tepe inhibisi dan isozim

 

 

 

Inhibisi enzim, tipe-tipe inhibisi enzim dan isozim

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami dan mempraktekkan tehnik-tehnik pemurnian protein dan penggunaan berbagai jenis kromatografi dan amini acid analyzer

 

 

Tehnik-tehnik biokimia untuk penelitian protein tanaman: Pemurnian protein, Kromatografi gel filtrasi, kromatografi afinitas, kromatografi penukar ion, HPLC, Amino acid analyzer

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami  dan mempraktekkan tehnik-tehnik pemurnian protein serta penentuan aktivitas enzim dan spesifik enzim serta SDS-PAGE

 

 

Lanjutan tehnik-tehnik untuk penelitian protein tanaman:Evaluasi kemurnian protein, cara penentuan aktivitas enzim dan aktivitas spesifik enzim, Elektrophoresis SDS-PAGE

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami genome sel dan DNA tumbuhan

 

Genome sel tanaman: Chromosome, DNA Plastid, DNA mitochondria; Transkripsi, sintesis protein

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami dan mempraktekkan penggunaan Electrophoresis  untuk analisis DNA, RFLP dan PCR

 

Electrophoresis agar untuk analisis DNA, RFLP, PCR

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

UJIAN TENGAH SEMESTER

 

 

Mahasiswa mampu memahami tehnik rekayasa tanaman transgenik

 

 

 

 

Rekayasa tanaman transgenic

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami proses bikokmia selama proses fotosintesis

 

 

 

Fotosintesis

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama berlangsungnya Siklus Calvin

 

 

 

Siklus Calvin

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama terjadinya

Asimilasi Nitrat:

 

Asimilasi Nitrat: Reduksi nitrat, Tempat berlangsungnya asimilasi nitrat, kontrol asimilasi nitrat, Produk akhir asimilasi nitrat

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama fiksasi nitrogen

 

 

 

Fiksasi nitrogen: Symbiosis dengan mikroba; kondisi oksigen pada fiksasi nitrogen

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia untuk berlangsungnya protein tersimpan dalam tumbuhan

 

 

Protein yang disimpan: Globulins; Prolamin; Protein-2S; Peranan Endoplasma rektikulum; Proteinase

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami pembentukan senyawa metabolit sekunder dan fungsi spesifik ekologik pada tumbuhan

 

 

Metabolit sekunder dan fungsi spesifik ekologik pada tumbuhan: Fungsi metabolit sekunder untuk tanaman; alkaloid; asam prusat; asam amino khusus pelindung tumbuhan

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

 

Mahasiswa mampu memahami pembentukan Hormon-hormon pengatur perkembangan tumbuhan

 

Hormon-hormon pengatur perkembangan tumbuhan: Rantai penyampaian pesan melalui hormone; Phytohormon: Auxin, Giberelin, Sitokinin, Asam absisat, Etilen, Hormon steroid & peptide tanaman, sensor cahaya

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2 x 50 menit

UJIAN AKHIR SEMESTER

 

 

 

 

 

RENCANA PEMBELAJARAN (RP)

MATAKULIAH BIOKIMIA TUMBUHAN

(AGR 513/3 SKS)

(SEMESTER GENAP)

 

 

STANDAR KOMPETENSI MATAKULIAH :

Setelah mempelajari mata kuliah Biokimia Tumbuhan diharapkan mahasiswa mampu memahami metabolisme yang terjadi dalam sel tumbuhan dan proses biokimia yang terkait dengan rekayasa genetika tumbuhan serta mampu mengaplikasikan dalam bidang pertanian

 

KOMPETENSI DASAR MATAKULIAH :

  1. Mahasiswa mampu memahami proses biokimia yang terjadi dalam sel tumbuhan meliputi fotosintesis, siklus Calvin, fiksasi nitrogen, asimilasi nitrat dan sulfur, pembentukan senyawasenyawa metabolit sekunder dan hormon pengatur perkembangan tumbuhan
  2. Mahasiswa mampu mengetahui protein,dan fungsinya, memahami enzim beserta fungsi dan aktivitasnya selama metabolisme pada tumbuhan
  3. Mahasiswa mampu memahami genome sel dan DNA tumbuhan dan prinsip dasar rekayasa genetik pada tumbuhan
  4. Mahasiswa mampu mempraktekkan tehnik-tehnik biokimia untuk isoalsi dan pemurnian protein dan enzim menggunakan berbagai jenis kromatografi dan Elektrophoresis SDS-PAGE

 

 

MINGGU KE

KOMPETENSI DASAR

MATERI PEMBELAJARAN

BENTUK PEMBELAJARAN

KRITERIA PENILAIAN (INDIKATOR)

BOBOT NILAI (%)

1

 

Mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi protein

 

 

Protein & Enzimologi: Struktur protein, fungsi protein, hubungan struktur protein dengan fungsinya

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

2

 

Mahasiswa mampu memahami fungsi dan kinetika enzim

 

Enzim dan kinetika enzim

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

3

 

Mahasiswa mampu memahami senyawa penghambat enzim, tipe-tepe inhibisi dan isozim

 

 

 

Inhibisi enzim, tipe-tipe inhibisi enzim dan isozim

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

4

 

Mahasiswa mampu memahami dan mempraktekkan tehnik-tehnik pemurnian protein dan penggunaan berbagai jenis kromatografi dan amini acid analyzer

 

 

Tehnik-tehnik biokimia untuk penelitian protein tanaman: Pemurnian protein, Kromatografi gel filtrasi, kromatografi afinitas, kromatografi penukar ion, HPLC, Amino acid analyzer

 

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

5

 

Mahasiswa mampu memahami  dan mempraktekkan tehnik-tehnik pemurnian protein serta penentuan aktivitas enzim dan spesifik enzim serta SDS-PAGE

 

 

Lanjutan tehnik-tehnik untuk penelitian protein tanaman:Evaluasi kemurnian protein, cara penentuan aktivitas enzim dan aktivitas spesifik enzim, Elektrophoresis SDS-PAGE

 

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

6

 

Mahasiswa mampu memahami genome sel dan DNA tumbuhan

 

Genome sel tanaman: Chromosome, DNA Plastid, DNA mitochondria; Transkripsi, sintesis protein

 

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

7

 

Mahasiswa mampu memahami dan mempraktekkan penggunaan Electrophoresis  untuk analisis DNA, RFLP dan PCR

 

Electrophoresis agar untuk analisis DNA, RFLP, PCR

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

8

                                                 UJIAN TENGAH SEMESTER (UTS) Ujian tertulis 30%

9

 

Mahasiswa mampu memahami tehnik rekayasa tanaman transgenik

 

 

 

 

Rekayasa tanaman transgenik

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

10

 

Mahasiswa mampu memahami proses bikokmia selama proses fotosintesis

 

 

 

Fotosintesis

 

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

11

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama berlangsungnya Siklus Calvin

 

 

 

Siklus Calvin

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

12

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama terjadinya

Asimilasi Nitrat:

 

Asimilasi Nitrat: Reduksi nitrat, Tempat berlangsungnya asimilasi nitrat, kontrol asimilasi nitrat, Produk akhir asimilasi nitrat

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

13

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia selama fiksasi nitrogen

 

 

 

Fiksasi nitrogen: Symbiosis dengan mikroba; kondisi oksigen pada fiksasi nitrogen

 

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

14

 

Mahasiswa mampu memahami proses biokimia untuk berlangsungnya protein tersimpan dalam tumbuhan

 

 

Protein yang disimpan: Globulins; Prolamin; Protein-2S; Peranan Endoplasma rektikulum; Proteinase

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

15

 

Mahasiswa mampu memahami pembentukan senyawa metabolit sekunder dan fungsi spesifik ekologik pada tumbuhan

 

 

Metabolit sekunder dan fungsi spesifik ekologik pada tumbuhan: Fungsi metabolit sekunder untuk tanaman; alkaloid; asam prusat; asam amino khusus pelindung tumbuhan

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

16.

 

Mahasiswa mampu memahami pembentukan Hormon-hormon pengatur perkembangan tumbuhan

 

Hormon-hormon pengatur perkembangan tumbuhan: Rantai penyampaian pesan melalui hormone; Phytohormon: Auxin, Giberelin, Sitokinin, Asam absisat, Etilen, Hormon steroid & peptide tanaman, sensor cahaya

 

Kuliah dan Diskusi

 

Tanya jawab pada jelang akhir tatap muka

17

UJIAN AKHIR SEMESTER (UAS)

Ujian tertulis

30


 

 

KONTRAK PERKULIAHAN

BIOKIMIA TUMBUHAN

(AGR-513)

PRODI MAGISTER ILMU PERTANIAN

FAKULTAS PERTANIAN-UNIVERSITAS RIAU

 

 

 

DOSEN PENGAMPU:

  1. Prof. Dr. Titania T. Nugroho, M.S. (Singkatan: TTN); email: titanianugroho@gmail.com
  2. Prof. Dr. Saryono, M. Si. (Singkatan SAR); email: sar_62@yahoo.co.id
  3. Prof. Dr. Usman Pato, M. Sc. (Singkatan UP); email: usmanpato@yahoo.com

 

No:

Pokok bahasan/sub-pokok bahasan

Waktu

Dosen

1. Protein & Enzimologi: Struktur protein, fungsi protein, hubungan struktur protein dengan fungsinya. Semester genap

SAR

2. Enzim dan kinetika enzim Semester genap

SAR

3.  Inhibisi enzim, tipe-tipe inhibisi enzim, dan isozim Semester genap

SAR

4. Tehnik-tehnik biokimia untuk penelitian protein tanaman: Pemurnian protein, Kromatografi gel filtrasi, kromatografi afinitas, kromatografi penukar ion, HPLC, Amino acid analyzer.  

Semester genap

SAR

5. Lanjutan tehnik-tehnik untuk penelitian protein tanaman:Evaluasi kemurnian protein, cara penentuan aktivitas enzim dan aktivitas spesifik enzim, Elektrophoresis SDS-PAGE. Semester genap

SAR

6. Genome sel tanaman: Chromosome, DNA Plastid, DNA mitochondria; Transkripsi, sintesis protein. Semester genap

TTN

7. Electrophoresis agar untuk analisis DNA, RFLP, PCR Semester genap

TTN

8. Ujian Tengah Semester Semester genap

SAR & TTN

9. Rekayasa tanaman transgenic Semester genap

TTN

10. Fotosintesis Semester genap

TTN

12. Siklus Calvin Semester genap

TTN

13. Asimilasi Nitrat: Reduksi nitrat, Tempat berlangsungnya asimilasi nitrat, kontrol asimilasi nitrat, Produk akhir asimilasi nitrat Semester genap

UP

14. Fiksasi nitrogen: Symbiosis dengan mikroba; kondisi oksigen pada fiksasi nitrogen Semester genap

UP

15. Protein yang disimpan: Globulins; Prolamin; Protein-2S; Peranan Endoplasma rektikulum; Proteinase. Semester genap

UP

16. Metabolit sekunder dan fungsi spesifik ekologik pada tumbuhan: Fungsi metabolit sekunder untuk tumbuhan; alkaloid; asam prusat; asam amino khusus pelindung tumbuhan Semester genap

UP

17. Hormon-hormon pengatur perkembangan tumbuhan: Rantai penyampaian pesan melalui hormone; Phytohormon: Auxin, Giberelin, Sitokinin, Asam absisat, Etilen, Hormon steroid & peptide tumbuhan, sensor cahaya. Semester genap

UP

18. Ujian akhir semester Semester genap

TTN & UP